玛丽鱼可进行品系繁殖即近亲繁殖，近亲繁殖是指有密切血统关系的个体之间进行交配，但此种方法不宜连续采用超过4代，否则会因遗传异而出现生理缺陷，如鱼体变小、 繁殖力减退、色泽不美等缺陷，品系繁殖是让有血缘相关的鱼相互交配，但血缘关系并不很密切，采用这种方法可以把一个固定的品系继续不断地繁殖下去;为维持优良品系，应严防混交、乱交，故雌雄鱼必须分养；在需要的时候，选择适当的亲鱼放入水族箱内进行繁殖，并作好记录标明何种雌鱼与何种雄鱼进行杂交，以便日后选取何种性别的鱼与它们的后代进行回交。
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